健康药业物流中心位于北京海淀区东北旺，仓库面积超过11000㎡，主要负责北京同仁堂健康药业股份有限公司所有物资和产品的仓储与全国配送。近几年，物流中心吸引了一大批高素质的物流人才的加盟，发展十分迅速，成功打造了多功能现代化仓储体系，从物资的储存到配送全部采用先进的ERP系统进行管理，已经形成以北京为中心，覆盖全国的快捷配送网络。物流中心还与中国人民财产保险公司建立了合作关系，将物流中心及各销售门店库存和在柜商品集中投保，有效地保证了公司财产安全。